27 квітня 1944 року у Ніжині був створений навчальний заклад під назвою школи ФЗН (фабрично-заводського навчання). Тут курсанти оволодівали спеціальностями, а саме: столяра, пічника, муляра, слюсаря, штукатура.З 1948 року Ніжинська школа ФЗН-4 стала ремісничим училищем № 3. В жовтні 1961 року реорганізоване в технічне училище № 13. В 1967 році разом з базовими підприємствами було збудовано новий сучасний навчальний корпус. Продовжуються будуватися їдальна на 150 місць, гуртожиток на 400 місць.
З 1993 року, у зв’язку із значним зменшенням обсягів меліоративних робіт, навчальний заклад постав перед проблемою виживання. З цього періоду училище розпочинає підготовку робітників для сільського господарства, для будівельних, монтажних і ремонтно-будівельних робіт, потім для автомобільного транспорту та електро-технічного виробництва.